Das Malteser Hospiz St. Raphael gehört zum Verbund Malteser Krankenhäuser, Einrichtungen der Altenhilfe und stationären Hospize unter dem Dach der MTG Malteser Trägergesellschaft gGmbH.

Besonders enge Beziehungen hat das Haus zu den Einrichtungen der Malteser St. Anna gGmbH, die als regionale Betriebsträgerschaft neben dem Malteser Hospiz St. Raphael folgende Einrichtungen trägt: